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MySQL InnoDB存储引擎崩溃恢复原理介绍

发布时间:2020-03-03 10:10:40来源:阅读:

前言

数据库系统与文件系统最大的区别在于数据库能保证操作的原子性,一个操作要么不做要么都做,即使在数据库宕机的情况下,也不会出现操作一半的情况,这个就需要数据库的日志和一套完善的崩溃恢复机制来保证。本文仔细剖析了InnoDB的崩溃恢复流程,代码基于5.6分支。

基础知识

lsn: 可以理解为数据库从创建以来产生的redo日志量,这个值越大,说明数据库的更新越多,也可以理解为更新的时刻。此外,每个数据页上也有一个lsn,表示最后被修改时的lsn,值越大表示越晚被修改。比如,数据页A的lsn为100,数据页B的lsn为200,checkpoint lsn为150,系统lsn为300,表示当前系统已经更新到300,小于150的数据页已经被刷到磁盘上,因此数据页A的最新数据一定在磁盘上,而数据页B则不一定,有可能还在内存中。

redo日志: 现代数据库都需要写redo日志,例如修改一条数据,首先写redo日志,然后再写数据。在写完redo日志后,就直接给客户端返回成功。这样虽然看过去多写了一次盘,但是由于把对磁盘的随机写入(写数据)转换成了顺序的写入(写redo日志),性能有很大幅度的提高。当数据库挂了之后,通过扫描redo日志,就能找出那些没有刷盘的数据页(在崩溃之前可能数据页仅仅在内存中修改了,但是还没来得及写盘),保证数据不丢。

undo日志: 数据库还提供类似撤销的功能,当你发现修改错一些数据时,可以使用rollback指令回滚之前的操作。这个功能需要undo日志来支持。此外,现代的关系型数据库为了提高并发(同一条记录,不同线程的读取不冲突,读写和写读不冲突,只有同时写才冲突),都实现了类似MVCC的机制,在InnoDB中,这个也依赖undo日志。为了实现统一的管理,与redo日志不同,undo日志在Buffer Pool中有对应的数据页,与普通的数据页一起管理,依据LRU规则也会被淘汰出内存,后续再从磁盘读取。与普通的数据页一样,对undo页的修改,也需要先写redo日志。

检查点: 英文名为checkpoint。数据库为了提高性能,数据页在内存修改后并不是每次都会刷到磁盘上。checkpoint之前的数据页保证一定落盘了,这样之前的日志就没有用了(由于InnoDB redolog日志循环使用,这时这部分日志就可以被覆盖),checkpoint之后的数据页有可能落盘,也有可能没有落盘,所以checkpoint之后的日志在崩溃恢复的时候还是需要被使用的。InnoDB会依据脏页的刷新情况,定期推进checkpoint,从而减少数据库崩溃恢复的时间。检查点的信息在第一个日志文件的头部。

崩溃恢复: 用户修改了数据,并且收到了成功的消息,然而对数据库来说,可能这个时候修改后的数据还没有落盘,如果这时候数据库挂了,重启后,数据库需要从日志中把这些修改后的数据给捞出来,重新写入磁盘,保证用户的数据不丢。这个从日志中捞数据的过程就是崩溃恢复的主要任务,也可以成为数据库前滚。当然,在崩溃恢复中还需要回滚没有提交的事务,提交没有提交成功的事务。由于回滚操作需要undo日志的支持,undo日志的完整性和可靠性需要redo日志来保证,所以崩溃恢复先做redo前滚,然后做undo回滚。

我们从源码角度仔细剖析一下数据库崩溃恢复过程。整个过程都在引擎初始化阶段完成(innobase_init),其中最主要的函数是innobase_start_or_create_for_mysql,innodb通过这个函数完成创建和初始化,包括崩溃恢复。首先来介绍一下数据库的前滚。

redo日志前滚数据库

前滚数据库,主要分为两阶段,首先是日志扫描阶段,扫描阶段按照数据页的space_id和page_no分发redo日志到hash_table中,保证同一个数据页的日志被分发到同一个哈希桶中,且按照lsn大小从小到大排序。扫描完后,再遍历整个哈希表,依次应用每个数据页的日志,应用完后,在数据页的状态上至少恢复到了崩溃之前的状态。我们来详细分析一下代码。

首先,打开所有的ibdata文件(open_or_create_data_files)(ibdata可以有多个),每个ibdata文件有个flush_lsn在头部,计算出这些文件中的max_flush_lsn和min_flush_lsn,因为ibdata也有可能有数据没写完整,需要恢复,后续(recv_recovery_from_checkpoint_start_func)通过比较checkpont_lsn和这两个值来确定是否需要对ibdata前滚。

接着,打开系统表空间和日志表空间的所有文件(fil_open_log_and_system_tablespace_files),防止出现文件句柄不足,清空buffer pool(buf_pool_invalidate)。接下来就进入最最核心的函数:recv_recovery_from_checkpoint_start_func,注意,即使数据库是正常关闭的,也会进入。

虽然recv_recovery_from_checkpoint_start_func看过去很冗长,但是很多代码都是为了LOG_ARCHIVE特性而编写的,真正数据崩溃恢复的代码其实不多。

首先,初始化一些变量,查看srv_force_recovery这个变量,如果用户设置跳过前滚阶段,函数直接返回。

接着,初始化recv_sys结构,分配hash_table的大小,同时初始化flush list rbtree。recv_sys结构主要在崩溃恢复前滚阶段使用。hash_table就是之前说的用来存不同数据页日志的哈希表,哈希表的大小被初始化为buffer_size_in_bytes/512, 这个是哈希表最大的长度,超过就存不下了,幸运的是,需要恢复的数据页的个数不会超过这个值,因为buffer poll最多(数据库崩溃之前脏页的上线)只能存放buffer_size_in_bytes/16KB个数据页,即使考虑压缩页,最多也只有buffer_size_in_bytes/1KB个,此外关于这个哈希表内存分配的大小,可以参考bug#53122。flush list rbtree这个主要是为了加入插入脏页列表,InnoDB的flush list必须按照数据页的最老修改lsn(oldest_modifcation)从小到大排序,在数据库正常运行时,可以通过log_sys->mutex和log_sys->log_flush_order_mutex保证顺序,在崩溃恢复则没有这种保证,应用数据的时候,是从第一个元素开始遍历哈希表,不能保证数据页按照最老修改lsn(oldest_modifcation)从小到大排序,这样就需要线性遍历flush_list来寻找插入位置,效率太低,因此引入红黑树,加快查找插入的位置。

接着,从ib_logfile0的头中读取checkpoint信息,主要包括checkpoint_lsn和checkpoint_no。由于InnoDB日志是循环使用的,且最少要有2个,所以ib_logfile0一定存在,把checkpoint信息存在里面很安全,不用担心被删除。checkpoint信息其实会写在文件头的两个地方,两个checkpoint域轮流写。为什么要两个地方轮流写呢?假设只有一个checkpoint域,一直更新这个域,而checkpoint域有512字节(OS_FILE_LOG_BLOCK_SIZE),如果刚好在写这个512字节的时候,数据库挂了,服务器也挂了(先不考虑硬件的原子写特性,早期的硬件没有这个特性),这个512字节可能只写了一半,导致整个checkpoint域不可用。这样数据库将无法做崩溃恢复,从而无法启动。如果有两个checkpoint域,那么即使一个写坏了,还可以用另外一个尝试恢复,虽然有可能这个时候日志已经被覆盖,但是至少提高了恢复成功的概率。两个checkpoint域轮流写,也能减少磁盘扇区故障带来的影响。checkpoint_lsn之前的数据页都已经落盘,不需要前滚,之后的数据页可能还没落盘,需要重新恢复出来,即使已经落盘也没关系,因为redo日志时幂等的,应用一次和应用两次都一样(底层实现: 如果数据页上的lsn大于等于当前redo日志的lsn,就不应用,否则应用。

checkpoint_no可以理解为checkpoint域写盘的次数,每次刷盘递增1,同时这个值取模2可以用来实现checkpoint_no域的轮流写。正常逻辑下,选取checkpoint_no值大的作为最终的checkpoint信息,用来做后续崩溃恢复扫描的起始点。
接着,使用checkpoint域的信息初始化recv_sys结构体的一些信息后,就进入日志解析的核心函数recv_group_scan_log_recs,这个函数后续我们再分析,主要作用就是解析redo日志,如果内存不够了,就直接调用应用(recv_apply_hashed_log_recs)日志,然后再接着解析。如果需要应用的日志很少,就仅仅解析分发日志,到recv_recovery_from_checkpoint_finish函数中在应用日志。

接着,依据当前刷盘的数据页状态做一次checkpoint,因为在recv_group_scan_log_recs里可能已经应用部分日志了。至此recv_recovery_from_checkpoint_start_func函数结束。

在recv_recovery_from_checkpoint_finish函数中,如果srv_force_recovery设置正确,就开始调用函数recv_apply_hashed_log_recs应用日志,然后等待刷脏的线程退出(线程是崩溃恢复时临时启动的),最后释放recv_sys的相关资源以及hash_table占用的内存。

至此,数据库前滚结束。接下来,我们详细分析一下redo日志解析函数以及redo日志应用函数的实现细节。

redo日志解析函数

解析函数的最上层是recv_group_scan_log_recs,这个函数调用底层函数(log_group_read_log_seg),按照RECV_SCAN_SIZE(64KB)大小分批读取。读取出来后,首先通过block_no和lsn之间的关系以及日志checksum判断是否读到了日志最后(所以可以看出,并没一个标记在日志头标记日志的有效位置,完全是按照上述两个条件判断是否到达了日志尾部),如果读到最后则返回(之前说了,即使数据库是正常关闭的,也要走崩溃恢复逻辑,那么在这里就返回了,因为正常关闭的checkpoint值一定是指向日志最后),否则则把日志去头掐尾放到一个recv_sys->buf中,日志头里面存了一些控制信息和checksum值,只是用来校验和定位,在真正的应用中没有用。在放到recv_sys->buf之前,需要检验一下recv_sys->buf有没有满(RECV_PARSING_BUF_SIZE,2M),满了就报错(如果上一批解析有不完整的日志,日志解析函数不会分发,而是把这些不完整的日志留在recv_sys->buf中,直到解析到完整的日志)。接下的事情就是从recv_sys->buf中解析日志(recv_parse_log_recs)。日志分两种:single_rec和multi_rec,前者表示只对一个数据页进行一种操作,后者表示对一个或者多个数据页进行多种操作。日志中还包括对应数据页的space_id,page_no,操作的type以及操作的内容(recv_parse_log_rec)。解析出相应的日志后,按照space_id和page_no进行哈希(如果对应的表空间在内存中不存在,则表示表已经被删除了),放到hash_table里面(日志真正存放的位置依然在buffer pool)即可,等待后续应用。这里有几个点值得注意:

如果是multi_rec类型,则只有遇到MLOG_MULTI_REC_END这个标记,日志才算完整,才会被分发到hash_table中。查看代码,我们可以发现multi_rec类型的日志被解析了两次,一次用来校验完整性(寻找MLOG_MULTI_REC_END),第二次才用来分发日志,感觉这是一个可以优化的点。

目前日志的操作type有50多种,每种操作后面的内容都不一样,所以长度也不一样,目前日志的解析逻辑,需要依次解析出所有的内容,然后确定长度,从而定位下一条日志的开始位置。这种方法效率略低,其实可以在每种操作的头上加上一个字段,存储后面内容的长度,这样就不需要解析太多的内容,从而提高解析速度,进一步提高崩溃恢复速度,从结果看,可以提高一倍的速度(从38秒到14秒,详情可以参见bug#82937)。

如果发现checkpoint之后还有日志,说明数据库之前没有正常关闭,需要做崩溃恢复,因此需要做一些额外的操作(recv_init_crash_recovery),比如在错误日志中打印我们常见的“Database was not shutdown normally!”和“Starting crash recovery.”,还要从double write buffer中检查是否发生了数据页半写,如果有需要恢复(buf_dblwr_process),还需要启动一个线程用来刷新应用日志产生的脏页(因为这个时候buf_flush_page_cleaner_thread还没有启动)。最后还需要打开所有的表空间。。注意是所有的表。。。我们在阿里云RDS MySQL的运维中,常常发现数据库hang在了崩溃恢复阶段,在错误日志中有类似“Reading tablespace information from the .ibd files…”字样,这就表示数据库正在打开所有的表,然后一看表的数量,发现有几十甚至上百万张表。。。数据库之所以要打开所有的表,是因为在分发日志的时候,需要确定space_id对应哪个ibd文件,通过打开所有的表,读取space_id信息来确定,另外一个原因是方便double write buffer检查半写数据页。针对这个表数量过多导致恢复过慢的问题,MySQL 5.7做了优化,WL#7142, 主要思想就是在每次checkpoint后,在第一次修改某个表时,先写一个新日志mlog_file_name(包括space_id和filename的映射),来表示对这个表进行了操作,后续对这个表的操作就不用写这个新日志了,当需要崩溃恢复时候,多一次扫描,通过搜集mlog_file_name来确定哪些表被修改过,这样就不需要打开所有的表来确定space_id了。

最后一个值得注意的地方是内存。之前说过,如果有太多的日志已经被分发,占用了太多的内存,日志解析函数会在适当的时候应用日志,而不是等到最后才一起应用。那么问题来了,使用了多大的内存就会出发应用日志逻辑。答案是:buffer_pool_size_in_bytes – 512 * buffer_pool_instance_num * 16KB。由于buffer_pool_instance_num一般不会太大,所以可以任务,buffer pool的大部分内存都被用来存放日志。剩下的那些主要留给应用日志时读取的数据页,因为目前来说日志应用是单线程的,读取一个日志,把所有日志应用完,然后就可以刷回磁盘了,不需要太多的内存。

redo日志应用函数

应用日志的上层函数为recv_apply_hashed_log_recs(应用日志也可能在io_helper函数中进行),主要作用就是遍历hash_table,从磁盘读取对每个数据页,依次应用哈希桶中的日志。应用完所有的日志后,如果需要则把buffer_pool的页面都刷盘,毕竟空间有限。有以下几点值得注意:

同一个数据页的日志必须按照lsn从小到大应用,否则数据会被覆盖。只应用redo日志lsn大于page_lsn的日志,只有这些日志需要重做,其余的忽略。应用完日志后,把脏页加入脏页列表,由于脏页列表是按照最老修改lsn(oldest_modification)来排序的,这里通过引入一颗红黑树来加速查找插入的位置,时间复杂度从之前的线性查找降为对数级别。

当需要某个数据页的时候,如果发现其没有在Buffer Pool中,则会查看这个数据页周围32个数据页,是否也需要做恢复,如果需要则可以一起读取出来,相当于做了一次io合并,减少io操作(recv_read_in_area)。由于这个是异步读取,所以最终应用日志的活儿是由io_helper线程来做的(buf_page_io_complete),此外,为了防止短时间发起太多的io,在代码中加了流量控制的逻辑(buf_read_recv_pages)。如果发现某个数据页在内存中,则直接调用recv_recover_page应用日志。由此我们可以看出,InnoDB应用日志其实并不是单线程的来应用日志的,除了崩溃恢复的主线程外,io_helper线程也会参与恢复。并发线程数取决于io_helper中读取线程的个数。

执行完了redo前滚数据库,数据库的所有数据页已经处于一致的状态,undo回滚数据库就可以安全的执行了。数据库崩溃的时候可能有一些没有提交的事务或者已经提交的事务,这个时候就需要决定是否提交。主要分为三步,首先是扫描undo日志,重新建立起undo日志链表,接着是,依据上一步建立起的链表,重建崩溃前的事务,即恢复当时事务的状态。最后,就是依据事务的不同状态,进行回滚或者提交。

undo日志回滚数据库

在recv_recovery_from_checkpoint_start_func之后,recv_recovery_from_checkpoint_finish之前,调用了trx_sys_init_at_db_start,这个函数做了上述三步中的前两步。

第一步在函数trx_rseg_array_init中处理,遍历整个undo日志空间(最多TRX_SYS_N_RSEGS(128)个segment),如果发现某个undo segment非空,就进行初始化(trx_rseg_create_instance)。整个每个undo segment,如果发现undo slot非空(最多TRX_RSEG_N_SLOTS(1024)个slot),也就行初始化(trx_undo_lists_init)。在初始化undo slot后,就把不同类型的undo日志放到不同链表中(trx_undo_mem_create_at_db_start)。undo日志主要分为两种:TRX_UNDO_INSERT和TRX_UNDO_UPDATE。前者主要是提供给insert操作用的,后者是给update和delete操作使用。之前说过,undo日志有两种作用,事务回滚时候用和MVCC快照读取时候用。由于insert的数据不需要提供给其他线程用,所以只要事务提交,就可以删除TRX_UNDO_INSERT类型的undo日志。TRX_UNDO_UPDATE在事务提交后还不能删除,需要保证没有快照使用它的时候,才能通过后台的purge线程清理。

第二步在函数trx_lists_init_at_db_start中进行,由于第一步中,已经在内存中建立起了undo_insert_list和undo_update_list(链表每个undo segment独立),所以这一步只需要遍历所有链表,重建起事务的状态(trx_resurrect_insert和trx_resurrect_update)。简单的说,如果undo日志的状态是TRX_UNDO_ACTIVE,则事务的状态为TRX_ACTIVE,如果undo日志的状态是TRX_UNDO_PREPARED,则事务的状态为TRX_PREPARED。这里还要考虑变量srv_force_recovery的设置,如果这个变量值为非0,所有的事务都会回滚(即事务被设置为TRX_ACTIVE),即使事务的状态应该为TRX_STATE_PREPARED。重建起事务后,按照事务id加入到trx_sys->trx_list链表中。最后,在函数trx_sys_init_at_db_start中,会统计所有需要回滚的事务(事务状态为TRX_ACTIVE)一共需要回滚多少行数据,输出到错误日志中,类似:5 transaction(s) which must be rolled back or cleaned up。InnoDB: in total 342232 row operations to undo的字样。

第三步的操作在两个地方被调用。一个是在recv_recovery_from_checkpoint_finish的最后,另外一个是在recv_recovery_rollback_active中。前者主要是回滚对数据字典的操作,也就是回滚DDL语句的操作,后者是回滚DML语句。前者是在数据库可提供服务之前必须完成,后者则可以在数据库提供服务(也即是崩溃恢复结束)之后继续进行(通过新开一个后台线程trx_rollback_or_clean_all_recovered来处理)。因为InnoDB认为数据字典是最重要的,必须要回滚到一致的状态才行,而用户表的数据可以稍微慢一点,对外提供服务后,慢慢恢复即可。因此我们常常在会发现数据库已经启动起来了,然后错误日志中还在不断的打印回滚事务的信息。事务回滚的核心函数是trx_rollback_or_clean_recovered,逻辑很简单,只需要遍历trx_sys->trx_list,按照事务不同的状态回滚或者提交即可(trx_rollback_resurrected)。这里要注意的是,如果事务是TRX_STATE_PREPARED状态,那么在InnoDB层,不做处理,需要在Server层依据binlog的情况来决定是否回滚事务,如果binlog已经写了,事务就提交,因为binlog写了就可能被传到备库,如果主库回滚会导致主备数据不一致,如果binlog没有写,就回滚事务。

崩溃恢复相关参数解析

innodb_fast_shutdown:
innodb_fast_shutdown = 0。这个表示在MySQL关闭的时候,执行slow shutdown,不但包括日志的刷盘,数据页的刷盘,还包括数据的清理(purge),ibuf的合并,buffer pool dump以及lazy table drop操作(如果表上有未完成的操作,即使执行了drop table且返回成功了,表也不一定立刻被删除)。
innodb_fast_shutdown = 1。这个是默认值,表示在MySQL关闭的时候,仅仅把日志和数据刷盘。
innodb_fast_shutdown = 2。这个表示关闭的时候,仅仅日志刷盘,其他什么都不做,就好像MySQL crash了一样。
这个参数值越大,MySQL关闭的速度越快,但是启动速度越慢,相当于把关闭时候需要做的工作挪到了崩溃恢复上。另外,如果MySQL要升级,建议使用第一种方式进行一次干净的shutdown。

innodb_force_recovery:
这个参数主要用来控制InnoDB启动时候做哪些工作,数值越大,做的工作越少,启动也更加容易,但是数据不一致的风险也越大。当MySQL因为某些不可控的原因不能启动时,可以设置这个参数,从1开始逐步递增,知道MySQL启动,然后使用SELECT INTO OUTFILE把数据导出,尽最大的努力减少数据丢失。
innodb_force_recovery = 0。这个是默认的参数,启动的时候会做所有的事情,包括redo日志应用,undo日志回滚,启动后台master和purge线程,ibuf合并。检测到了数据页损坏了,如果是系统表空间的,则会crash,用户表空间的,则打错误日志。
innodb_force_recovery = 1。如果检测到数据页损坏了,不会crash也不会报错(buf_page_io_complete),启动的时候也不会校验表空间第一个数据页的正确性(fil_check_first_page),表空间无法访问也继续做崩溃恢复(fil_open_single_table_tablespace、fil_load_single_table_tablespace),ddl操作不能进行(check_if_supported_inplace_alter),同时数据库也被不能进行写入操作(row_insert_for_mysql、row_update_for_mysql等),所有的prepare事务也会被回滚(trx_resurrect_insert、trx_resurrect_update_in_prepared_state)。这个选项还是很常用的,数据页可能是因为磁盘坏了而损坏了,设置为1,能保证数据库正常启动。
innodb_force_recovery = 2。除了设置1之后的操作不会运行,后台的master和purge线程就不会启动了(srv_master_thread、srv_purge_coordinator_thread等),当你发现数据库因为这两个线程的原因而无法启动时,可以设置。
innodb_force_recovery = 3。除了设置2之后的操作不会运行,undo回滚数据库也不会进行,但是回滚段依然会被扫描,undo链表也依然会被创建(trx_sys_init_at_db_start)。srv_read_only_mode会被打开。
innodb_force_recovery = 4。除了设置3之后的操作不会运行,ibuf的操作也不会运行(ibuf_merge_or_delete_for_page),表信息统计的线程也不会运行(因为一个坏的索引页会导致数据库崩溃)(info_low、dict_stats_update等)。从这个选项开始,之后的所有选项,都会损坏数据,慎重使用。
innodb_force_recovery = 5。除了设置4之后的操作不会运行,回滚段也不会被扫描(recv_recovery_rollback_active),undo链表也不会被创建,这个主要用在undo日志被写坏的情况下。
innodb_force_recovery = 6。除了设置5之后的操作不会运行,数据库前滚操作也不会进行,包括解析和应用(recv_recovery_from_checkpoint_start_func)。

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